ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการผลิตยาที่มีสารประกอบไซโคลโพรเพนซึ่งแสดงฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ต้านไวรัส ต้านแบคทีเรีย หรือผลต่อระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างกระดูกไซโคลโพรเพนที่แข็งและหมู่ฟังก์ชันทำให้มีคุณค่าในเคมีเภสัชกรรมเพื่อเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความเลือกในการจับมัด นิยมใช้ในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์และตัวปรับตัวรับเนื่องจากความสามารถในการเลียนแบบพันธะเปปไทด์หรือจำกัดการคอนฟอร์เมชันของโมเลกุล นอกจากนี้ยังนำมาใช้ในสารเคมีเกษตรเพื่อออกแบบโมเลกุลชีวภาพที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อม