ไอโซโพรพิล ไซโคลโพรเพนซัลโฟเนต ถูกนำมาใช้หลักๆ ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารเคมีที่หลากหลาย มักถูกใช้ในการเตรียมอนุพันธ์ไซโคลโพรเพน ซึ่งเป็นสารกลางที่มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของสารนี้ช่วยให้สามารถเข้าร่วมในปฏิกิริยาไซโคลโพรเพนเนชันต่างๆ ซึ่งช่วยในการก่อตัวของสารประกอบวงแหวนที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการพัฒนาโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการออกแบบยาที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่ศาสตร์วัสดุศาสตร์ ซึ่งใช้ในการปรับเปลี่ยนโพลิเมอร์เพื่อเพิ่มคุณสมบัติ เช่น ความคงทนต่อความร้อนและความต้านทานต่อสารเคมี