ไซโคลเพนเทนอะซีโตไนไทรล์ถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารประกอบอินทรีย์ต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าต่อการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการผลิตสารเคมีพิเศษ โดยกลุ่มไนไทรล์สามารถแปลงเป็นหมู่ฟังก์ชันอื่นๆ เช่น อะมีนหรือกรดคาร์บอกซิลิก ผ่านปฏิกิริยาเคมี ความหลากหลายของมันยังขยายไปสู่การวิจัยและพัฒนา ซึ่งทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับออกแบบสารประกอบใหม่ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่เป็นไปได้