1,2,3-ไซโคลเฮกเซนไทรอลถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาและเคมีภัณฑ์ละเอียด โครงสร้างไตรออลของมันมีคุณค่าต่อการพัฒนาโมเลกุลคีรอล ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างยาที่บริสุทธิ์ทางเอนานติโอเมอร์ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมโพลิเมอร์และเรซิน โดยซึ่งกลุ่มฮายดรอกซิลช่วยในการเชื่อมขวางและปรับปรุงคุณสมบัติของวัสดุ ในงานวิจัย มันถูกใช้เป็นหน่วยย่อยสำหรับศึกษาสเตอรีโอเคมีและกลไกปฏิกิริยา การประยุกต์ใช้นี้ยังขยายไปสู่สาขาเคมีเกษตร โดยช่วยในการจัดทำส่วนผสมออกฤทธิ์สำหรับการป้องกันพืช