Ethyl 3-aminocyclohexanecarboxylate hydrochloride ถูกนำไปใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารกลางสำคัญสำหรับการผลิตสารประกอบเภสัชกรรมหลากหลายชนิด มันมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีศักยภาพในการเป็นยาต้านซึมเศร้าหรือยาลดอาการวิตกกังวล นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในงานวิจัยเพื่อสร้างโมเลกุลใหม่ที่มีการประยุกต์ใช้ทางบำบัด โดยมักทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างโครงสร้างเคมีที่ซับซ้อน ความเสถียรและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าสำคัญในเคมียารักษาและกระบวนการค้นพบยา