3-(Chloromethyl)-1,1-difluorocyclobutane เป็นสารเคมีที่ใช้หลักๆ เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรต่างๆ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ซึ่งประกอบด้วยวงแหวนไซโคลบิวเทนพร้อมหมู่ย่อยแทน difluoro และ chloromethyl ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ใช้ในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่โรคระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากวงแหวนไซโคลบิวเทนสามารถเพิ่มความสามารถในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ในงานสารเคมีเกษตร ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง โดยกลุ่ม difluoro สามารถปรับปรุงประสิทธิภาพและความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อมของสารประกอบ นอกจากนี้ ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการผลิตโพลิเมอร์พิเศษ โดยคุณสมบัติโครงสร้างช่วยในการพัฒนาวัสดุที่มีความทนทานต่อความร้อนและเคมีสูงขึ้น