tert-Butyl 3,3-difluorocyclobutanecarboxylate เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตสารตั้งต้นสำหรับยาหรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างที่มีวงไซโคลบิวเทนและฟลูออรีนทำให้สารนี้มีคุณสมบัติเฉพาะที่เหมาะสำหรับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างโมเลกุลในขั้นตอนการวิจัยและพัฒนา ยา นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีเพื่อพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ๆ ที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น