ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่มุ่งเป้าไปยังโรคระบบประสาทส่วนกลางและโรคเมแทบอลิซึม โครงสร้างไซโคลบิวเทนที่มีฟลูออรีนแทนที่ช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาเพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพยาและเภสัชจลนศาสตร์ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมตัวยับยั้งเอนไซม์และตัวปรับตัวรับที่ซึ่งความแข็งของโครงสร้างและผลกระทบทางอิเล็กทรอนิกส์มีความสำคัญ