ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบเปปไทด์และสารชีวโมเลกุลที่มีโครงสร้างเฉพาะ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อสร้างสารต้นแบบของยารุ่นใหม่ นิยมใช้เป็นตัวตั้งต้นในการสร้างโครงสร้างไซคลิกหรือเปปทิดอมิโนกรดที่มีความเฉพาะเจาะจงสูง เนื่องจากหมู่ Boc และ Fmoc ช่วยป้องกันหมู่อะมิโนในขั้นตอนการสังเคราะห์แบบขั้นตอน ทำให้ควบคุมทิศทางของปฏิกิริยาได้ดี เหมาะสำหรับการสร้างเปปไทด์ที่มีโครงสร้างพับตัวเฉพาะตัว เช่น สารยับยั้งเอนไซม์หรือลิแกนด์สำหรับตัวรับในเซลล์