ไซยาไนน์ 5 NHS ester ถูกใช้อย่างแพร่หลายในด้านการถ่ายภาพทางชีวภาพและการติดฉลากโมเลกุล เนื่องจากมีเรืองแสงที่แข็งแกร่งในบริเวณใกล้อินฟราเรด มักใช้ในการติดฉลากโปรตีน, แอนติบอดี, เพปไทด์, และกรดนิวคลีอิก เพื่อให้ผู้วิจัยสามารถติดตามและแสดงภาพชีวโมเลกุลเหล่านี้ในงานทดลองทางชีววิทยาต่างๆ กลุ่มปฏิกิริยา NHS ester ที่ตอบสนองช่วยให้เกิดการคอนจูเกตที่มีประสิทธิภาพกับอะมีนปฐมภูมิ ส่งผลให้เกิดการติดฉลากที่เสถียรและจำเพาะ สารเคมีนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการใช้กล้องจุลทรรศน์ฟลูออเรสเซนส์, การวิเคราะห์เซลล์ด้วยโฟลว์ไซโตเมทรี, และการถ่ายภาพในร่างกาย (in vivo) ซึ่งการปล่อยแสงที่สว่างและความเสถียรต่อแสงช่วยเพิ่มความชัดเจนและความแม่นยำของผลการทดลอง นอกจากนี้ ยังใช้ในงานวินิจฉัย เช่น อิมมูโนแอสเซย์และระบบตรวจจับแบบฟลูออเรสเซนส์ สนับสนุนความก้าวหน้าทางการวิจัยทางการแพทย์และการวินิจฉัย