ไซยาไนน์ 7 NHS เอสเทอร์ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวการแพทย์สำหรับการติดฉลากสารชีวโมเลกุล เช่น โปรตีน เปปไทด์ และแอนติบอดี คุณสมบัติการเรืองแสงใกล้อินฟราเรดทำให้เหมาะสำหรับการถ่ายภาพในร่างกาย (in vivo) ช่วยให้นักวิจัยติดตามกระบวนการเซลล์และตรวจสอบความก้าวหน้าของโรคแบบเรียลไทม์ มีประโยชน์อย่างยิ่งในการวิจัยมะเร็งสำหรับการตรวจจับและถ่ายภาพเนื้องอก เนื่องจากการทะลุทะลวงเนื้อเยื่อลึกและการรบกวนพื้นหลังน้อย นอกจากนี้ ยังใช้ในวินิจฉัยระดับโมเลกุลสำหรับพัฒนาการทดสอบที่ไวต่อ และในการศึกษาการส่งยาเพื่อแสดงภาพการกระจายของยารักษา ความเสถียรและปฏิกิริยาสูงกับกลุ่มอะมิโนทำให้เป็นเครื่องมือที่หลากหลายสำหรับการคอนจูเกตในสถานการณ์ทดลองต่างๆ