สารเคมีนี้ใช้หลักในฐานะสารตัวกลางที่หลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อน โครงสร้างที่มีไอโอดีนและพันธะเอเทอร์หลายแห่ง ทำให้เหมาะสำหรับการนำไปใช้ในการพัฒนาโพลิเมอร์ สารลดแรงตึงผิว และวัสดุพิเศษ มักใช้ในการสร้างอนุพันธ์ของคราวน์เอเทอร์ ซึ่งมีประโยชน์ในการจดจำและแยกไอออน นอกจากนี้ยังเป็นหน่วยย่อยในการสังเคราะห์สารประกอบสำหรับงานวิจัยเภสัชกรรม โดยใช้คุณสมบัติเฉพาะตัวในการออกแบบยาหรือระบบนำยา แอตอมไอโอดีนยังทำให้เป็นผู้สมัครที่เหมาะสำหรับการศึกษาการติดฉลากรังสีในงานถ่ายภาพทางการแพทย์หรือการวินิจฉัย