(6-Methoxy-1,5-naphthyridin-4-yl)boronic acid เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนกับสารประกอบอริลหรือวินิลฮาไลด์ สารนี้มักใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทอโรไซคลิกที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากมีกลุ่มโบรอนที่ทำปฏิกิริยาได้ดีและกลุ่มเมทอกซีที่ช่วยเพิ่มความเสถียรของโมเลกุล นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการวิจัยและพัฒนายาเพื่อศึกษากลไกการออกฤทธิ์หรือปรับปรุงประสิทธิภาพของสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม รวมถึงการพัฒนาโพรบเรืองแสงหรือเซ็นเซอร์เนื่องจากส่วน naphthyridine ที่มีคุณสมบัติทางโฟโตฟิสิกส์ที่เป็นเอกลักษณ์ และการประยุกต์ใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ เช่น การรวมเข้าในโพลิเมอร์หรือโมเลกุลขนาดเล็กสำหรับการออกแบบวัสดุขั้นสูง