(4-Cyano-3,5-difluorophenyl)boronic acid ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นส่วนประกอบหลักสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น กลุ่มฟังก์ชันโบรอนิกแอซิดทำให้เป็นสารเคมีที่มีค่ามากในปฏิกิริยาครอส-คัพปลิง Suzuki-Miyaura ซึ่งใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์ยา สารเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง การมีสารย่อยไซยาโนและฟลูออรีนเพิ่มความตอบสนองและความเลือกกรานในปฏิกิริยาเหล่านี้ ทำให้สามารถสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนด้วยประสิทธิภาพสูง นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังใช้ในการพัฒนาสารประกอบที่มีฤทธิ์ชีวภาพและเป็นสารกลางในการผลิตลิแกนด์สำหรับการเร่งปฏิกิริยา โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครยังทำให้เหมาะสำหรับการออกแบบเซ็นเซอร์และโพรบสำหรับตรวจจับสารวิเคราะห์เฉพาะในระบบเคมีและชีวภาพ