(2-Methoxy-5-(trifluoromethoxy)phenyl)boronic acid ใช้หลัก ๆ ในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในปฏิกิริยาการคู่ข้าม Suzuki-Miyaura ปฏิกิริยานี้ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและวิทยาศาสตร์วัสดุเพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ซึ่งช่วยให้สามารถสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนได้ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ เนื่องจากความสามารถในการนำกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะเข้าไปในระบบอะโรมาติก นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาวัสดุขั้นสูง เช่น เซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์และผลึกเหลว ซึ่งโครงสร้างโมเลกุลที่แม่นยำมีความสำคัญต่อคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์หรือคุณสมบัติทางแสงที่ต้องการ กลุ่ม trifluoromethoxy ของมันช่วยเพิ่มความเสถียรและปฏิกิริยาของกรดโบรอนิก ทำให้เป็นสารเคมีที่มีค่ามากในเคมีสังเคราะห์สมัยใหม่