เฟอร์โรซีนบอโรนิกแอซิด ถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในปฏิกิริยาซึ่งเกี่ยวข้องกับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน โดยเฉพาะในปฏิกิริยาของซูซูกิ-มิยาวากิ ซึ่งเป็นที่นิยมในสังเคราะห์สารอินทรีย์ เนื่องจากกลุ่มบอโรนิกแอซิดสามารถทำปฏิกิริยากับเฮลิดของอารมาติกได้อย่างมีประสิทธิภาพ สารนี้จึงมีบทบาทสำคัญในการสร้างสารประกอบที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น สารชีวภาพและยา นอกจากนี้ เฟอร์โรซีนบอโรนิกแอซิดยังถูกนำมาใช้ในงานเซนเซอร์เคมี โดยเฉพาะเซนเซอร์ตรวจจับน้ำตาลหรือโมเลกุลที่มีหมู่ไดออล เนื่องจากบอโรนิกแอซิดสามารถจับกับไดออลได้อย่างเฉพาะเจาะจง ทำให้สามารถประยุกต์ใช้ในระบบตรวจวัดทางชีวภาพ ในด้านวัสดุ เฟอร์โรซีนซึ่งมีคุณสมบัติทางอิเล็กโทรเคมีที่ดี ช่วยให้สารนี้เหมาะสำหรับใช้ในอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์เชิงอินทรีย์ หรือเป็นโมเลกุลนำส่งยาที่สามารถติดตามได้ด้วยการวัดสัญญาณไฟฟ้า