TNP ถูกใช้อย่างแพร่หลายในสาขาเคมีวิเคราะห์ในฐานะสารเคมีสำหรับตรวจจับและวัดปริมาณโปรตีน โดยทำปฏิกิริยากับกลุ่มอะมิโนในโปรตีน สร้างคอมเพล็กซ์ที่มีสีซึ่งสามารถวัดได้ด้วยวิธีสเปกโตรโฟโตเมตรี ทำให้มีคุณค่าต่อการทดสอบความเข้มข้นของโปรตีน นอกจากนี้ TNP ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางชีวเคมีเพื่อศึกษาการโต้ตอบและการดัดแปลงของโปรตีน เนื่องจากมีความจำเพาะต่อกลุ่มอะมิโน ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม TNP ทำหน้าที่เป็นเครื่องมือสำหรับการควบคุมคุณภาพและกระบวนการพัฒนายา โดยเฉพาะในการประเมินยาที่มีฐานเป็นโปรตีน การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่สาขาวิทยาศาสตร์สิ่งแวดล้อม โดยใช้ในการวิเคราะห์ปริมาณโปรตีนในตัวอย่างน้ำและดิน เพื่อช่วยในการตรวจสอบมลพิษและการศึกษาระบบนิเวศ