ใช้เป็นสารตั้งต้นในเทคนิคการตรวจจับกิจกรรมของเอนไซม์ β-galactosidase โดยเฉพาะในงานวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุล เช่น การตรวจสอบการแสดงออกของยีนที่ใช้ตัวรายงาน (reporter gene) ที่ควบคุมด้วยโปรโมเตอร์ lacZ เมื่อเอนไซม์ β-galactosidase ย่อยสารนี้ จะปลดปล่อย 3-indoxyl ซึ่งต่อมาออกซิไดซ์กลายเป็นผลึกสีน้ำเงินที่มองเห็นได้ชัด ทำให้สามารถตรวจหาตำแหน่งหรือระดับของกิจกรรมเอนไซม์ได้ทั้งในแผ่นเพททรี หรือเนื้อเยื่อ นิยมใช้ในวิธี X-gal staining เพื่อแสดงผลการถ่ายยีน การกลายพันธุ์ หรือการพัฒนารูปแบบของเซลล์