ใช้ในงานวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุล โดยเฉพาะในการตรวจสอบกิจกรรมของเอนไซม์ β-galactosidase ซึ่งมักใช้เป็นตัวรายงาน (reporter enzyme) ในการศึกษาการแสดงออกของยีน เมื่อเอนไซม์นี้ทำปฏิกิริยากับสารนี้ จะเกิดผลิตภัณฑ์ที่มีสีสามารถตรวจวัดได้ ทำให้เหมาะสำหรับการวิเคราะห์เชิงปริมาณในระบบเซลล์ การใช้สารนี้จึงนิยมในงานทดลองที่ต้องการติดตามการเปิด-ปิดของยีนที่ควบคุมด้วยโปรโมเตอร์ lac หรือระบบที่เกี่ยวข้องกับการควบคุมยีนในแบคทีเรียและเซลล์สัตว์