Silica-PO3H ถูกใช้อย่างแพร่หลายในโครมาโตกราฟีเป็นเฟสสถานีเนื่องจากคุณสมบัติการแลกเปลี่ยนไอออนที่แข็งแกร่ง โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประสิทธิภาพในการแยกและทำให้บริสุทธิ์โมเลกุลชีวภาพ เช่น โปรตีน เพปไทด์ และกรดนิวคลีอิก กลุ่มกรดฟอสโฟนิกบนพื้นผิวซิลิก้าช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเลือกสรรกับโมเลกุลที่มีประจุบวก ทำให้มีคุณค่าต่อโครมาโตกราฟีวิเคราะห์และเตรียม นอกจากนี้ ยังใช้ในกระบวนการบำบัดน้ำเพื่อกำจัดไอออนโลหะหนัก โดยอาศัยความสัมพันธ์สูงต่อไคชัน ความคงทนและความหนาแน่นของกลุ่มฟังก์ชันยังทำให้เป็นวัสดุที่มีประโยชน์ในปฏิกิริยาเร่งและเป็นตัวรองรับสำหรับตรึงเอนไซม์ในงานอุตสาหกรรม