Hexadecyltrimethylammonium bisulfate ใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารลดแรงตึงผิวในแอปพลิเคชันอุตสาหกรรมและห้องปฏิบัติการต่างๆ มีประสิทธิภาพโดยเฉพาะในการทำให้อิมัลชันและการกระจายตัวเสถียร ทำให้มีคุณค่าในการปรุงสูตรผลิตภัณฑ์ดูแลส่วนบุคคล เช่น แชมพู ครีมนวดผม และครีมบำรุงผิว ในอุตสาหกรรมสิ่งทอ ทำหน้าที่เป็นสารทำให้อ่อนนุ่มและสารป้องกันไฟฟ้าสถิต ปรับปรุงความรู้สึกและการจัดการของผ้า นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์อนุภาคนาโน โดยทำหน้าที่เป็นสารห่อหุ้มเพื่อควบคุมขนาดและรูปร่างของอนุภาค ในสาขาเทคโนโลยีชีวภาพ ใช้ในกระบวนการสกัด DNA เพื่ออำนวยความสะดวกในการทำลายเซลล์และการทำให้บริสุทธิ์กรดนิวคลีอิก คุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ของมันยังทำให้เหมาะสำหรับใช้ในน้ำยาฆ่าเชื้อและสารฆ่าเชื้อ โดยมีประสิทธิภาพในการทำลายแบคทีเรียและไวรัส นิยมใช้ในผลิตภัณฑ์ทำความสะอาดพื้น ผ้า และอุปกรณ์ต่างๆ รวมถึงเป็นตัวช่วยในการสังเคราะห์สารอื่นๆ และส่วนประกอบในสารปรับสภาพน้ำเพื่อกำจัดสิ่งสกปรกและจุลินทรีย์