N-Benzylcinchonidinium Chloride ใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาแบบ chiral phase-transfer catalyst ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความสำคัญทางเภสัชกรรมและอุตสาหกรรม โดยเฉพาะในการสร้างสารประกอบที่มี chiral center ซึ่งจำเป็นสำหรับการผลิตยาที่มีความเฉพาะเจาะจงและประสิทธิภาพสูง ตัวเร่งปฏิกิริยานี้ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความสามารถในการเลือกสรร (selectivity) ของปฏิกิริยา ทำให้ได้ผลิตภัณฑ์ที่มีความบริสุทธิ์ทางแสง (optical purity) สูง นอกจากนี้ยังใช้ในปฏิกิริยาออกซิเดชันและปฏิกิริยาอื่นๆ ที่ต้องการการควบคุม stereochemistry อย่างแม่นยำ ซึ่งเป็นประโยชน์ในการพัฒนายาและสารเคมีที่มีความซับซ้อนทางโครงสร้าง