(S)-3-Aminobutan-2-one hydrochloride ใช้หลักในการสังเคราะห์สารกลางคีรอลสำหรับเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการผลิตส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการสเตอรีโอเคมีเฉพาะ มันทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท เช่น โรคอัลไซเมอร์และโรคพาร์กินสัน เนื่องจากความสามารถในการมีอิทธิพลต่อระบบสารสื่อประสาท นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตร ซึ่งคุณสมบัติคีรอลช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช ในการวิจัย ใช้เป็นตัวเรขสำหรับการสังเคราะห์แบบอะซิมเมトリก ซึ่งช่วยสร้างโมเลกุลซับซ้อนด้วยความบริสุทธิ์เอ็นแอนติโอเมอร์สูง รูปแบบไฮโดรคลอไรด์ช่วยให้เสถียรและละลายน้ำได้ดี ทำให้เหมาะสำหรับปฏิกิริยาเคมีและสูตรต่างๆ