(R)-(3-ไตรฟลูออโรเมทิล)แมนเดลิกแอซิด ใช้หลักๆ เป็นบล็อกสร้างที่มีคีรอลในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และเคมีภัณฑ์ละเอียด กลุ่มไตรฟลูออโรเมทิลของมันช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมของสารประกอบ ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนายา มันมักถูกใช้ในการผลิตยาที่บริสุทธิ์แบบเอนานติโอเมอร์ โดยเฉพาะในสาขายาต้านการอักเสบ ยาต้านไวรัส และยาต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร ซึ่งคุณสมบัติโครงสร้างของมันช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของส่วนผสมออกฤทธิ์ ความเป็นคีรอลของมันยังถูกนำมาใช้ในสังเคราะห์แบบอะซิมเมตริกเพื่อสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีความแม่นยำทางสเตอริโอเคมีสูง