(R)-1-Boc-2-isobutylpiperazine hydrochloride เป็นสารเคมีที่ใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างที่มีกลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) และไอโซบิวทิล ช่วยให้สารนี้มีเสถียรภาพและสามารถใช้เป็นสารกลางในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนได้ สารนี้มักถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และสารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งเป็นส่วนสำคัญในการออกแบบยาชนิดใหม่ นอกจากนี้ ยังสามารถใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารออกฤทธิ์ทางประสาทหรือสารที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากโครงสร้างของ piperazine ที่มีศักยภาพในการจับกับรีเซพเตอร์เฉพาะในร่างกาย นอกจากนี้ (R)-1-Boc-2-isobutylpiperazine hydrochloride ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาวิจัยทางเคมีเพื่อพัฒนายาต้านมะเร็งหรือยาต้านจุลชีพ โดยอาศัยความสามารถในการปรับเปลี่ยนโครงสร้างเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียงของยา