ใช้เป็นสาร derivatizing แบบ chiral ในการวิเคราะห์กรดอะมิโนและแอมีน โดยเฉพาะในก๊าซโครมาโทกราฟีและสเปกโตรเมตรีมวลสาร กลุ่มไตรฟลูออโรอะซิลช่วยเพิ่มความเหินไหลและให้คุณสมบัติรับอิเล็กตรอนที่แข็งแกร่ง ทำให้เพิ่มความไวในการตรวจจับ นิยมใช้ในงานศึกษาสเตอรีโอเคมีเนื่องจากสามารถสร้างอนุพันธ์ diastereomeric เพื่อแยกและวัดปริมาณ enantiomer ได้ นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีอินทรีย์สังเคราะห์สำหรับกลยุทธ์การป้องกันและกระตุ้นในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ รวมถึงเป็นตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบเปปไทด์และยาที่มีโครงสร้างของกรดอะมิโน โดยเฉพาะในกระบวนการป้องกันหมู่อะมิโนของแวลีนระหว่างการสร้างพันธะเปปไทด์ เนื่องจากกลุ่มไตรฟลูออโรอะซิลช่วยป้องกันการเกิดปฏิกิริยาข้างเคียงและสามารถถอดออกได้อย่างมีประสิทธิภาพภายหลัง นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยด้านเคมีอินทรีย์และเภสัชกรรมสำหรับพัฒนายาที่ต้องการความเฉพาะเจาะจงสูง