trans-3-amino-cyclohexanol hydrochloride ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะอย่างยิ่งเป็นบล็อกก่อสร้างในการสังเคราะห์สารประกอบชีวภาพต่าง ๆ โครงสร้างของมันทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าในการสร้างยาที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติทางระบบประสาท เช่น ยาต้านซึมเศร้าและยาแก้กังวล นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนาโมเลกุลคีเรล ซึ่งจำเป็นสำหรับการผลิตยาที่บริสุทธิ์แบบเอนานติโอเมอร์ สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในเคมีอินทรีย์สำหรับศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาเส้นทางสังเคราะห์ใหม่ ๆ การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปถึงการผลิตสารเคมีละเอียดและวัสดุพิเศษ ซึ่งคุณสมบัติที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยในการปรับปรุงกระบวนการเคมี