Trans-3-Aminocyclopentanol hydrochloride ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาสารประกอบชีวภาพต่างๆ โดยเฉพาะที่มุ่งเป้าไปยังระบบประสาทและระบบหัวใจและหลอดเลือด โครงสร้างของมันมีคุณค่าในการสร้างโครงสร้างพื้นฐานแบบ cyclopentane ซึ่งจำเป็นในการออกแบบยาที่มีคุณสมบัติ stereochemical เฉพาะ นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์ลิแกนด์ chiral และตัวเร่งปฏิกิริยา เพื่อช่วยในกระบวนการสังเคราะห์แบบ asymmetric สารประกอบนี้ยังถูกสำรวจในเคมียารักษาโรคสำหรับบทบาทที่เป็นไปได้ในการสร้างตัวแทนบำบัดใหม่ๆ รวมถึงสำหรับการรักษาความผิดปกติทางเมแทบอลิซึมและการติดเชื้อ