ใช้ D-Alaninol เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่มีโครงสร้างเปปไทด์หรือสารยับยั้งเอนไซม์ นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวทำหน้าที่เป็นชิรัลเอเจนต์หรือบิลดิ้งบล็อกในการสร้างโมเลกุลที่มีความเฉพาะตัวของศูนย์อสมมาตร ซึ่งมีความสำคัญต่อการพัฒนายาที่ต้องการความจำเพาะสูง เช่น ยาต้านจุลชีพและยาในกลุ่มเบต้า-แลคแทม รวมถึงใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีเพื่อศึกษาการทำงานของโปรตีนและเอนไซม์