ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตเปปไทด์ที่ต้องการความบริสุทธิ์สูงและมีโครงสร้างเฉพาะตัว เนื่องจากหมู่ Fmoc ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันหมู่อะมิโน ช่วยควบคุมการสร้างพันธะเปปไทด์ในขั้นตอนต่าง ๆ ได้อย่างแม่นยำ สารนี้มีโครงสร้างไซคลิกที่มีหมู่เมท็อกซี ซึ่งช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายในตัวทำละลายอินทรีย์ และช่วยปรับปรุงคุณสมบัติทางชีวภาพของเปปไทด์ที่สังเคราะห์ได้ มักใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อพัฒนายาที่มีฤทธิ์เฉพาะจุด โดยเฉพาะยาต้านมะเร็งหรือสารกระตุ้นระบบประสาทที่ต้องการความจำเพาะสูง