(S)-2-Amino-3-methoxypropanoic acid hydrochloride ถูกนำมาใช้ในงานวิจัยทางเคมีและชีววิทยาเพื่อศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และกระบวนการเมแทบอลิซึมของเซลล์ นอกจากนี้ยังถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาและสารออกฤทธิ์ทางประสาท ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม สารนี้มีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาใหม่ๆ โดยเฉพาะยาที่เกี่ยวข้องกับการรักษาโรคทางระบบประสาทและภาวะผิดปกติของเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในกระบวนการผลิตสารเคมีที่มีความซับซ้อนและมีความเฉพาะทางสูงอีกด้วย