2-Methylcyclohexylamine (cis/trans) ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการผลิตส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) โครงสร้างของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างแบบ chiral ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารประกอบที่บริสุทธิ์แบบ enantiomer ซึ่งสำคัญต่อประสิทธิภาพและความปลอดภัยของยา

ในด้านสารเคมีเกษตร มันทำหน้าที่เป็นสารตัวกลางในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง สนับสนุนการพัฒนาสารประกอบที่ช่วยเพิ่มการป้องกันพืชและผลผลิต

นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการผลิตสารเคมีพิเศษ เช่น สารยับยั้งการกัดกร่อนและสารลดแรงตึงผิว ซึ่งจำเป็นในกระบวนการอุตสาหกรรม ความหลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการวิจัยและพัฒนาในอุตสาหกรรมเคมีต่างๆ