(S)-1-(2,5-Difluorophenyl)ethanamine hydrochloride ใช้ในการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการผลิตยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้าและยารักษาโรคทางจิตเวช นอกจากนี้ยังอาจถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการพัฒนายาใหม่ที่มีความจำเพาะต่อตัวรับในสมอง ช่วยในการปรับสมดุลของสารสื่อประสาท ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการรักษาภาวะทางจิตเวชและระบบประสาท