(R)-1-Methyl-prop-2-ynylamine hydrochloride ใช้เป็นบล็อกสร้างที่มีคีรอลในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตยาเภสัชกรรม มันทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท เช่น โรคอัลไซเมอร์และโรคพาร์กินสัน ลักษณะคีรอลของมันช่วยให้สามารถสร้างสารประกอบที่มีเอนานติโอเมอร์บริสุทธิ์ ซึ่งมีความสำคัญต่อการรับประกันประสิทธิภาพและความปลอดภัยของตัวแทนบำบัด นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพและลิแกนด์สำหรับการเร่งปฏิกิริยาแบบไม่สมมาตร ช่วยในการผลิตโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนด้วยการควบคุมสเตอรีโอเคมีในระดับสูง