(2S,6S)-2,6-Dimethylmorpholine ถูกใช้หลักly เป็นบล็อกก่อสร้างแบบ chiral ในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมต่างๆ คุณสมบัติ stereochemistry ของมันทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนายาที่บริสุทธิ์แบบ enantiomer โดยเฉพาะในการผลิตส่วนประกอบยาที่ใช้งานได้ (APIs) ที่ต้องการการกำหนดค่า chiral เฉพาะสำหรับประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาหรือลิแกนด์ในการสังเคราะห์แบบ asymmetric ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มี stereoselectivity สูงในการวิจัย agrochemical มันถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชแบบ chiral ซึ่งช่วยเพิ่มความจำเพาะและลดผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อม การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่สาขาเคมีอินทรีย์ ซึ่งถูกนำมาใช้ในการเตรียมสารเคมีละเอียดและสารกลาง