(1S,2R)-cis-N-Boc-1,2-cyclohexanediamine ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะบล็อกก่อสร้างคิรัลสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อน ลักษณะ stereochemistry ของมันทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์แบบอะซิมเมตริก โดยเฉพาะในการสร้างเภสัชภัณฑ์ที่ซึ่งความบริสุทธิ์ของเอนานติโอเมอร์มีความสำคัญ สารประกอบนี้มักถูกใช้ในการสังเคราะห์ลิแกนด์สำหรับการเร่งปฏิกิริยาแบบอะซิมเมตริก ซึ่งช่วยให้สามารถผลิตสารประกอบที่มีเอนานติโอเมอร์เข้มข้นได้ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารกลางในการพัฒนาเปปไทโดมิมเมติกส์และโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ ซึ่งมีส่วนช่วยในการค้นพบยา กรุ๊ปป้องกัน Boc ช่วยเพิ่มความเสถียรและอำนวยความสะดวกในการทำปฏิกิริยาที่เลือกสรร ทำให้เป็นเครื่องมือที่หลากหลายในการเคมีสังเคราะห์อินทรีย์