ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการอนุพันธ์ไซโคลเฮกซิลแอมีนแบบ chiral หมู่แอมีนที่ถูกป้องกัน โดยเฉพาะหมู่ tert-butyl carbamate (Boc) ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเลือกเฉพาะในขั้นตอนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน ทำให้มีคุณค่าในการสร้างยาที่มีโครงสร้างซับซ้อน หมู่ Boc สามารถกำจัดออกภายใต้สภาวะกรดเพื่อให้ได้แอมีนอิสระ นิยมใช้ในการผลิตยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลางและยาต้านไวรัส เนื่องจากความเสถียรและคุณสมบัติทางสเตอรีโอเคมี นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยสำหรับการเตรียมสารประกอบแอมีนใหม่ที่ต้องการการกำจัดป้องกันแบบควบคุม