S-2-N-Cbz-Propane-1,2-diamine hydrochloride ใช้หลักในงานวิจัยและพัฒนายา โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้หลากหลาย สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการเตรียมเอมีนคีรอล (chiral amines) ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างยาที่บริสุทธิ์ทางเอนานติโอเมอร์ (enantiomerically pure drugs) การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การผลิตยาที่มีฐานจากเปปไทด์ (peptide-based therapeutics) โดยช่วยในการนำเข้าชนิดกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะ

นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์ (enzyme inhibitors) และตัวปรับตัวรับ (receptor modulators) ซึ่งช่วยส่งเสริมความก้าวหน้าในเคมียารักษา (medicinal chemistry) ความเสถียรและปฏิกิริยาของสารนี้ทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบสำหรับการแปลงสารอินทรีย์ที่ซับซ้อนในกระบวนการค้นพบยา