ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง หมู่อัลกอฮอล์ที่ได้รับการป้องกันด้วยไซลิลช่วยให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกสรรได้ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน ทำให้มีคุณค่ากในการสร้างกรอบโมเลกุลที่ซับซ้อน โครงสร้างวงแหวนและตำแหน่งของหมู่ฟังก์ชันของสารนี้สนับสนุนปฏิกิริยาที่ควบคุมสเตอรีโอ ซึ่งจำเป็นในการผลิตโมเลกุลชีวภาพที่มีความบริสุทธิ์สูงและการกำหนดค่าที่ต้องการ ใช้กันอย่างแพร่หลายในงานวิจัยสำหรับการปรับเปลี่ยนยาตัวสมัครเพื่อปรับปรุงความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสามารถในการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ โดยเฉพาะในสารอนุพันธ์ไซโคลบิวเทนอล