Clomipramine HCl ใช้หลักในการรักษาโรคย้ำคิดย้ำทำ (OCD) เพื่อช่วยลดความคิดที่ไม่พึงประสงค์และพฤติกรรมบังคับ นอกจากนี้ยังใช้รักษาภาวะอื่นๆ เช่น โรคซึมเศร้า โรคตื่นตระหนก และกลุ่มอาการปวดเรื้อรัง เช่น ปวดเส้นประสาท ยานี้ทำงานโดยเพิ่มระดับสารสื่อประสาทบางชนิดในสมอง ซึ่งช่วยปรับปรุงอารมณ์และลดความวิตกกังวล นอกจากนี้ บางครั้งใช้แบบ off-label เพื่อจัดการอาการ cataplexy ที่เกี่ยวข้องกับโรคนอนหลับมากเกิน (narcolepsy) และความผิดปกติการนอนหลับบางชนิด การใช้ต้องมีการติดตามอย่างใกล้ชิดโดยบุคลากรทางการแพทย์เพื่อปรับขนาดยาและจัดการผลข้างเคียงที่อาจเกิดขึ้น