ไรฟาซิมิ้นใช้ในการรักษาโรคติดเชื้อในระบบทางเดินอาหาร โดยเฉพาะอย่างยิ่งอาการท้องร่วงของผู้เดินทางที่เกิดจากเชื้อ E. coli นอกจากนี้ยังมีประสิทธิภาพในการจัดการกับอาการลำไส้แปรปรวนชนิดท้องเสีย (IBS-D) โดยช่วยลดอาการเช่นอาการท้องอืดและปวดท้อง นอกจากนี้ยังใช้ป้องกันภาวะสมองเสื่อมจากตับ ซึ่งเป็นภาวะที่เกิดจากความผิดปกติของตับที่ส่งผลต่อการทำงานของสมอง คุณสมบัติที่ไม่ถูกดูดซึมเข้าสู่กระแสเลือดทำให้เหมาะสำหรับการรักษาปัญหาเฉพาะในลำไส้โดยมีผลข้างเคียงน้อย