สารโปรคลอราซใช้เป็นสารฆ่าเชื้อราในภาคการเกษตร โดยเฉพาะในการควบคุมโรคเชื้อราที่เกิดกับพืช เช่น โรคใบไหม้ โรคเน่า หรือราต่างๆ ที่มักพบในพืชผลไม้ ข้าว มันสำปะหลัง และพืชไร่ชนิดอื่นๆ นิยมใช้พ่นหรือฉีดพ่นลงบนใบ พื้นดิน หรือใช้สำหรับแช่เมล็ดพันธุ์ก่อนปลูกเพื่อป้องกันการติดเชื้อราในระยะแรกของการเจริญเติบโต นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมการเก็บรักษาผลไม้ โดยเฉพาะผลไม้สดที่ต้องส่งออก เพื่อยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อราในระหว่างการขนส่งและจัดเก็บ ช่วยยืดอายุการเก็บได้ยาวนานขึ้น สารนี้มีฤทธิ์ครอบคลุมต่อเชื้อราหลายชนิด ทั้งราสีเทา ราดำ และเชื้อราที่ก่อให้เกิดโรคโคนเน่า จึงเป็นสารที่เกษตรกรนิยมใช้ในระบบการจัดการศัตรูพืชแบบผสมผสาน