ใช้คาร์เบนดาซิมเป็นสารฆ่าเชื้อราในภาคการเกษตร เพื่อควบคุมโรคที่เกิดจากเชื้อราในพืชหลากหลายชนิด เช่น โรคเน่า โรคเหี่ยว และโรคใบจุด โดยเฉพาะในพืชผลไม้ ผัก และพืชไร่ เช่น ส้ม กล้วย มันสำปะหลัง และข้าว นิยมใช้โดยการพ่นสารลงบนใบหรือดิน ช่วยป้องกันและยับยั้งการงอกของสปอร์เชื้อรา รวมถึงการเจริญเติบโตของเส้นใยเชื้อรา ทำให้ลดการสูญเสียผลผลิตและช่วยรักษาคุณภาพของผลผลิตทางการเกษตร