อิมีดาโซลถูกใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมยาเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะยาต้านเชื้อรา เช่น ketoconazole และ clotrimazole มันมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาที่เกี่ยวข้องกับฮิสตามีน เนื่องจากโครงสร้างที่คล้ายกับส่วนข้างของฮิสติ딘ตามธรรมชาติ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์และตัวแอนตาโกนิสต์รีเซพเตอร์

ในการวิจัยทางชีวเคมี อิมีดาโซลถูกใช้บ่อยครั้งเป็นบัฟเฟอร์ในงานทดลองทางชีววิทยาและชีวเคมี โดยเฉพาะในการทำให้โปรตีนบริสุทธิ์ มันเป็นส่วนประกอบสำคัญในโครมาโตกราฟีแบบ affinity ด้วยนิกเกิล ซึ่งช่วยให้โปรตีนที่มีแท็กฮิสติ딘หลุดออกโดยการแข่งขันกับฮิสติ딘สำหรับการจับกับไอออนนิกเกิล

อนุพันธ์ของอิมีดาโซลยังถูกใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร เช่น ยาต้านเชื้อราและยาฆ่าแมลง เนื่องจากความสามารถในการรบกวนเยื่อหุ้มเซลล์เชื้อราและระบบเอนไซม์ นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์ของเหลวไอออนิกและเป็นสารยับยั้งการกัดกร่อนในระบบอุตสาหกรรม

ความหลากหลายในเคมีเชิงประสานของมันทำให้มีประโยชน์ในการเร่งปฏิกิริยา โดยเฉพาะในคอมเพล็กซ์ออร์กาโนเมทัลลิกที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์ อิมีดาโซลยังสามารถทำหน้าที่เป็นสารเร่งหรือสารเติมแต่งในเรซินและโพลิเมอร์เพื่อเพิ่มความทนทานต่อความร้อนและความชื้น และอนุพันธ์ถูกนำมาใช้ในผลิตภัณฑ์ดูแลส่วนบุคคล เช่น ครีมที่มีคุณสมบัติต้านเชื้อรา