Pantoprazole Sodium Sesquihydrate ใช้กันอย่างแพร่หลายในการรักษาโรคทางเดินอาหาร โดยเฉพาะโรคที่เกี่ยวข้องกับการผลิตกรดในกระเพาะอาหารมากเกินไป มักถูกสั่งจ่ายสำหรับภาวะเช่น โรคกรดไหลย้อน (GERD) ซึ่งช่วยบรรเทาอาการเช่น แสบร้อนกลางอกและการไหลย้อนของกรด โดยการลดการหลั่งกรดในกระเพาะ นอกจากนี้ ยังมีประสิทธิภาพในการจัดการแผลเปปติก ทั้งในกระเพาะอาหารและลำไส้เล็กส่วนต้น โดยส่งเสริมการหายและป้องกันการกำเริบ ยังใช้ร่วมกับยาปฏิชีวนะเพื่อกำจัดเชื้อ Helicobacter pylori ซึ่งเป็นสาเหตุหลักของแผลในกระเพาะ นอกจากนี้ ยังให้แก่ผู้ป่วยที่มีกลุ่มอาการ Zollinger-Ellison ซึ่งเป็นภาวะหายากที่ผลิตกรดมากเกินไป การออกฤทธิ์นานและผลข้างเคียงน้อยทำให้เป็นตัวเลือกที่นิยมสำหรับโรคที่เกี่ยวข้องกับกรด มักใช้ในรูปแบบยาชนิดรับประทาน และควรใช้ตามคำแนะนำของแพทย์เพื่อประสิทธิภาพสูงสุดและลดผลข้างเคียง