อะโทรปีนซัลเฟตโมนโฮไดรต์ใช้อย่างแพร่หลายในสถานพยาบาลในฐานะยาต้านโคลินเออร์จิก มักใช้รักษาภาวะหัวใจเต้นช้าซึ่งเป็นภาวะที่มีอัตราการเต้นของหัวใจช้าผิดปกติ โดยการยับยั้งการทำงานของเส้นประสาทเวกัสต่อหัวใจ ช่วยเพิ่มอัตราการเต้นของหัวใจและปรับปรุงการไหลเวียนของเลือดหัวใจ นอกจากนี้ ใช้เป็นยาเตรียมก่อนผ่าตัดเพื่อลดการหลั่งน้ำลายและสารคัดหลั่งในทางเดินหายใจ ซึ่งช่วยรักษาทางเดินหายใจให้สะอาดระหว่างการผ่าตัด ในจักษุวิทยา ใช้เป็นยาหยอดตาเพื่อขยายรูม่านตาและทำให้กลไกการโฟกัสของตาชั่วคราวเป็นอัมพาต ช่วยในการตรวจตาและการรักษาบางอย่าง ยังใช้เป็นยาแก้พิษสำหรับการวางยาพิษจากยาฆ่าแมลงออร์กาโนฟอสเฟตและสารประสาท โดยต่อต้านผลกระทบจากกิจกรรมอะเซทิลโคลีนที่มากเกินไป นอกจากนี้ ใช้ในการจัดการโรคทางเดินอาหาร เช่น กลุ่มอาการลำไส้ระคายเคืองและแผลในกระเพาะอาหาร โดยลดการเกร็งและการหลั่งกรด