อาร์ทีซูเนตใช้หลักในการเป็นยาต้านมาลาเรีย โดยเฉพาะสำหรับการรักษามาลาเรียชนิดรุนแรง มีประสิทธิภาพสูงในการลดปริมาณปรสิตในเลือดอย่างรวดเร็ว ทำให้เป็นส่วนประกอบที่สำคัญในพื้นที่ที่เป็นโรคมาลาเรียระบาด ยานี้มักให้ทางหลอดเลือดดำหรือกล้ามเนื้อในกรณีรุนแรง เพื่อให้ออกฤทธิ์รวดเร็ว นอกจากนี้ อาร์ทีซูเนตบางครั้งใช้ร่วมกับยาต้านมาลาเรียอื่นๆ เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและป้องกันการพัฒนาการดื้อยา นอกเหนือจากมาลาเรีย การวิจัยกำลังสำรวจศักยภาพในการรักษามะเร็งบางชนิด เนื่องจากความสามารถในการเหนี่ยวนำการตายของเซลล์มะเร็ง (apoptosis) นอกจากนี้ยังมีการศึกษาคุณสมบัติต้านการอักเสบและต้านไวรัส แม้ว่าการประยุกต์ใช้นี้ยังอยู่ในขั้นตอนทดลอง