Colistin Methanesulfonate sodium salt ใช้ในการรักษาโรคติดเชื้อแบคทีเรียที่ดื้อต่อยาปฏิชีวนะชนิดอื่น โดยเฉพาะเชื้อแบคทีเรียแกรมลบ เช่น Pseudomonas aeruginosa และ Acinetobacter baumannii มักใช้ในผู้ป่วยที่ติดเชื้อรุนแรงในระบบทางเดินหายใจ ระบบทางเดินปัสสาวะ หรือการติดเชื้อในกระแสเลือด นอกจากนี้ยังใช้ในการรักษาผู้ป่วยที่มีภาวะภูมิคุ้มกันบกพร่องหรือผู้ที่ได้รับการปลูกถ่ายอวัยวะ ซึ่งมีความเสี่ยงสูงต่อการติดเชื้อแบคทีเรียดื้อยา การใช้ยานี้ต้องอยู่ภายใต้การดูแลของแพทย์อย่างใกล้ชิดเนื่องจากอาจมีผลข้างเคียงต่อไตและระบบประสาทได้