โคลแคลซิเฟอรอล (D3) ใช้ในการป้องกันและรักษาภาวะขาดวิตามินดี ซึ่งอาจนำไปสู่โรคกระดูกอ่อน (rickets) ในเด็กและโรคกระดูกอ่อน (osteomalacia) ในผู้ใหญ่ ช่วยในการดูดซึมแคลเซียมและฟอสฟอรัสในลำไส้ เพื่อเสริมสร้างความแข็งแรงของกระดูกและฟัน มักถูกเติมลงในผลิตภัณฑ์เสริมอาหารและอาหารเสริมธาตุ เช่น นม ซีเรียล และน้ำส้ม เพื่อให้ได้รับปริมาณที่เพียงพอ โดยเฉพาะในพื้นที่ที่มีแสงแดดจำกัด ในสถานพยาบาล ใช้รักษาโรคกระดูกพรุน ภาวะฮอร์โมนพาราไทรอยด์ต่ำ หรือผู้ป่วยหลังผ่าตัดต่อมไทรอยด์ ช่วยเพิ่มความหนาแน่นของกระดูกและลดความเสี่ยงการแตกหัก นอกจากนี้ยังสนับสนุนการทำงานของระบบภูมิคุ้มกัน และมีการศึกษาถึงประโยชน์ในการลดความเสี่ยงของโรคเรื้อรังบางชนิด เช่น โรคหัวใจและหลอดเลือด และโรคภูมิต้านตนเอง