เดควาลิเนียม คลอไรด์ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารฆ่าเชื้อและยาฆ่าเชื้อ โดยเฉพาะในการรักษาการติดเชื้อในช่องปากและลำคอ มักพบในรูปแบบยาอมและน้ำยาบ้วนปาก ซึ่งช่วยลดการเจริญเติบโตของแบคทีเรียและเชื้อรา ให้ความบรรเทาจากอาการเจ็บคอและการติดเชื้อในช่องปาก

ในสูตินรีเวชศาสตร์ เดควาลิเนียม คลอไรด์ถูกใช้ในรูปแบบเม็ดช่องคลอดหรือ suppositories เพื่อรักษา bacterial vaginosis และการติดเชื้อในช่องคลอดอื่นๆ คุณสมบัติต้านจุลชีพช่วยฟื้นฟูสมดุลของ flora ในช่องคลอดตามธรรมชาติ

นอกจากนี้ ยังใช้ในครีมและ ointment ทาเฉพาะที่สำหรับการติดเชื้อผิวหนัง โดยต่อสู้กับแบคทีเรียและเชื้อราอย่างมีประสิทธิภาพ ส่งเสริมการหายของแผลและป้องกันการติดเชื้อเพิ่มเติม

เดควาลิเนียม คลอไรด์ยังถูกนำมาใช้ในการเก็บรักษาผลิตภัณฑ์เครื่องสำอาง โดยทำหน้าที่เป็นสารกันเสียเพื่อป้องกันการปนเปื้อนของจุลชีพและยืดอายุการเก็บของผลิตภัณฑ์

กิจกรรมต้านจุลชีพแบบ broad-spectrum ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในแอพพลิเคชันทางการแพทย์และการดูแลส่วนบุคคลต่างๆ